Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccndbp1Q3TVC7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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