Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3TQQ9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q3TQQ9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q3TQQ9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q3TQQ9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q3TQQ9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q3TQQ9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3TQQ9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3TQQ9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3TQQ9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3TQQ9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3TQQ9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3TQQ9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3TQQ9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3TQQ9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Q3TQQ9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms