Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CiartQ3TQ03 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms