Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctdnep1Q3TP92 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctdnep1Q3TP92 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctdnep1Q3TP92 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctdnep1Q3TP92 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctdnep1Q3TP92 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctdnep1Q3TP92 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctdnep1Q3TP92 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctdnep1Q3TP92 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctdnep1Q3TP92 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctdnep1Q3TP92 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctdnep1Q3TP92 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctdnep1Q3TP92 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctdnep1Q3TP92 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctdnep1Q3TP92 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctdnep1Q3TP92 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctdnep1Q3TP92 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ctdnep1Q3TP92 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ctdnep1Q3TP92 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ctdnep1Q3TP92 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ctdnep1Q3TP92 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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