Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc102aQ3TMW1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc102aQ3TMW1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms