Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Jmjd8Q3TA59 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd8Q3TA59 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms