Protein–RNA interactions for Protein: Q307W7

Kncn, Kinocilin, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KncnQ307W7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KncnQ307W7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KncnQ307W7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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KncnQ307W7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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KncnQ307W7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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KncnQ307W7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KncnQ307W7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms