Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chrna5Q2MKA5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms