Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Shroom4Q1W617 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Shroom4Q1W617 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Shroom4Q1W617 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Shroom4Q1W617 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Shroom4Q1W617 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Shroom4Q1W617 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Shroom4Q1W617 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Shroom4Q1W617 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Shroom4Q1W617 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Shroom4Q1W617 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Shroom4Q1W617 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Shroom4Q1W617 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Shroom4Q1W617 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Shroom4Q1W617 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Shroom4Q1W617 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
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