Protein–RNA interactions for Protein: Q14DL3

Lrriq3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq3Q14DL3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lrriq3Q14DL3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrriq3Q14DL3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms