Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Fam171bQ14CH0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam171bQ14CH0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms