Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpusd2Q149F1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpusd2Q149F1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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