Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VgfQ0VGU4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms