Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gli2Q0VGT2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gli2Q0VGT2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gli2Q0VGT2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms