Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim24Q0VG18 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms