Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp2b3Q0VF55 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2b3Q0VF55 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms