Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rundc1Q0VDN7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rundc1Q0VDN7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms