Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntnap5cQ0V8T7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntnap5cQ0V8T7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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