Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Vps8Q0P5W1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms