Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrioQ0KL02 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TrioQ0KL02 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms