Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf541Q0GGX2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf541Q0GGX2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms