Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700061G19RikQ08EE8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms