Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssrp1Q08943 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms