Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Siah1bQ06985 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms