Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CluQ06890 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CluQ06890 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CluQ06890 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CluQ06890 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CluQ06890 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CluQ06890 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CluQ06890 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CluQ06890 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CluQ06890 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CluQ06890 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CluQ06890 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CluQ06890 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CluQ06890 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CluQ06890 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CluQ06890 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CluQ06890 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CluQ06890 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CluQ06890 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CluQ06890 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CluQ06890 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CluQ06890 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CluQ06890 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CluQ06890 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CluQ06890 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CluQ06890 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CluQ06890 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CluQ06890 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CluQ06890 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CluQ06890 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CluQ06890 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CluQ06890 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CluQ06890 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CluQ06890 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CluQ06890 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CluQ06890 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CluQ06890 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CluQ06890 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CluQ06890 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CluQ06890 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CluQ06890 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CluQ06890 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CluQ06890 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CluQ06890 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CluQ06890 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CluQ06890 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CluQ06890 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CluQ06890 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CluQ06890 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CluQ06890 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CluQ06890 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CluQ06890 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CluQ06890 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CluQ06890 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CluQ06890 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CluQ06890 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CluQ06890 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CluQ06890 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CluQ06890 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CluQ06890 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CluQ06890 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CluQ06890 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CluQ06890 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CluQ06890 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CluQ06890 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CluQ06890 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CluQ06890 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CluQ06890 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CluQ06890 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CluQ06890 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CluQ06890 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CluQ06890 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CluQ06890 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CluQ06890 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CluQ06890 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CluQ06890 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CluQ06890 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CluQ06890 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CluQ06890 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CluQ06890 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CluQ06890 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CluQ06890 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CluQ06890 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CluQ06890 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CluQ06890 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CluQ06890 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CluQ06890 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CluQ06890 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CluQ06890 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CluQ06890 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CluQ06890 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CluQ06890 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CluQ06890 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CluQ06890 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CluQ06890 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CluQ06890 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CluQ06890 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CluQ06890 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CluQ06890 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CluQ06890 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms