Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Dnal1Q05A62 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnal1Q05A62 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms