Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PtprgQ05909 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprgQ05909 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms