Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Fmn1Q05860 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Fmn1Q05860 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fmn1Q05860 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms