Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Scg2Q03517 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms