Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacna1sQ02789 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna1sQ02789 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna1sQ02789 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms