Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col6a2Q02788 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms