Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nhlh1Q02576 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlh1Q02576 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms