Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdcd1Q02242 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcd1Q02242 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms