Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snai1Q02085 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snai1Q02085 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms