Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ly9Q01965 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ly9Q01965 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ly9Q01965 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ly9Q01965 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ly9Q01965 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ly9Q01965 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ly9Q01965 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ly9Q01965 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ly9Q01965 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ly9Q01965 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ly9Q01965 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ly9Q01965 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ly9Q01965 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ly9Q01965 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ly9Q01965 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ly9Q01965 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ly9Q01965 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ly9Q01965 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ly9Q01965 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ly9Q01965 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms