Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VcpQ01853 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
VcpQ01853 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VcpQ01853 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VcpQ01853 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VcpQ01853 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VcpQ01853 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
VcpQ01853 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VcpQ01853 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VcpQ01853 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VcpQ01853 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VcpQ01853 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VcpQ01853 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VcpQ01853 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VcpQ01853 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VcpQ01853 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms