Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme2Q01768 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms