Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SelpQ01102 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SelpQ01102 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SelpQ01102 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SelpQ01102 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SelpQ01102 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SelpQ01102 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SelpQ01102 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SelpQ01102 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SelpQ01102 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SelpQ01102 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SelpQ01102 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms