Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb2Q00977 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb2Q00977 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb2Q00977 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb2Q00977 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb2Q00977 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb2Q00977 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb2Q00977 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb2Q00977 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms