Protein–RNA interactions for Protein: Q00780

Col8a1, Collagen alpha-1(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a1Q00780 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col8a1Q00780 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms