Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp4Q00724 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp4Q00724 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms