Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pax8Q00288 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax8Q00288 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms