Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp10Q000W5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp10Q000W5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms