Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarcc1P97496 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarcc1P97496 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcc1P97496 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms