Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkp1P97350 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp1P97350 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms