Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nkx2-3P97334 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx2-3P97334 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms