Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Mesp1P97309 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Mesp1P97309 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Mesp1P97309 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mesp1P97309 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms