Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl21cP86793 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl21cP86793 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl21cP86793 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl21cP86793 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl21cP86793 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl21cP86793 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms