Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubg1P83887 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg1P83887 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms