Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otx2P80206 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otx2P80206 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otx2P80206 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx2P80206 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx2P80206 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otx2P80206 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otx2P80206 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otx2P80206 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otx2P80206 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otx2P80206 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Otx2P80206 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Otx2P80206 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms